Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc170D3YXL0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms