Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms