Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap58B2RW38 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms