Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrt4B2RU40 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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