Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint7A7XV04 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms