Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn3aA2ASI5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms