Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtf1A2AQ19 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms