Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms