Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Speer3W4VSP1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Speer3W4VSP1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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