Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms