Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms