Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam50bQ9WTJ8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam50bQ9WTJ8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms