Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TapbpQ9R233 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TapbpQ9R233 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TapbpQ9R233 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TapbpQ9R233 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TapbpQ9R233 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TapbpQ9R233 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms