Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms