Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtsjQ9R014 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.7 ms