Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf4Q9QZS2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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