Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms