Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms