Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnnt3Q9QZ47 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms