Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tomm40Q9QYA2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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