Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc5Q9QX29 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms