Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms