Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms