Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cog8Q9JJA2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cog8Q9JJA2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cog8Q9JJA2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cog8Q9JJA2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cog8Q9JJA2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cog8Q9JJA2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cog8Q9JJA2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cog8Q9JJA2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms