Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn12Q9ET43 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms