Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SgshQ9EQ08 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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SgshQ9EQ08 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SgshQ9EQ08 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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