Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms