Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4bQ9D8B3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms