Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms