Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rtl8cQ9D6I0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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