Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9bQ9D6E4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms