Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4A5

Uncharacterized protein C16orf86 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4A5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4A5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms