Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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