Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms