Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms