Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms