Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf146Q9CZW6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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