Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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