Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snf8Q9CZ28 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snf8Q9CZ28 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snf8Q9CZ28 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snf8Q9CZ28 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snf8Q9CZ28 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Snf8Q9CZ28 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Snf8Q9CZ28 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snf8Q9CZ28 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snf8Q9CZ28 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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