Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc8Q9CYA6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms