Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mis12Q9CY25 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms