Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Sgo1Q9CXH7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Sgo1Q9CXH7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Sgo1Q9CXH7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Sgo1Q9CXH7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Sgo1Q9CXH7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Sgo1Q9CXH7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sgo1Q9CXH7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sgo1Q9CXH7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sgo1Q9CXH7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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