Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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