Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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