Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms