Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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