Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Chchd5Q9CQP3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms