Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Nicn1Q9CQM0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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