Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ergic3Q9CQE7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms