Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms